Bioinformatici ontmaskeren windpokkenvirus

Het virus (Varicella zoster) dat bij kinderen de windpokken en bij volwassenen gordelroos (zona) veroorzaakt is, net als vele andere virussen, gespecialiseerd in het ontwijken van het menselijk afweersysteem. Wetenschappers van de Universiteit Antwerpen slaagden er nu in een mechanisme bloot te leggen waardoor de veroorzaker van windpokken en gordelroos zich kan ‘verbergen’.

De onderzoekers lieten innovatieve bioinformaticamodellen los op het virus. 'We ontdekten dat de samenstelling van de virale eiwitten niet op toeval berust', zegt Pieter Meysman. 'De samenstelling evolueerde zodanig dat de virale eiwitten die een rol spelen tijdens het meest kwetsbare moment van de besmetting moeilijker herkend kunnen worden door ons immuunsysteem.'

Dit is wellicht het gevolg van de biologische ‘wapenwedloop’ die doorheen de evolutie tussen het virus en het menselijk organisme werd uitgevochten. Virussen staan immers onder een enorme evolutionaire druk om zo lang mogelijk te overleven in de mens. Het gevonden ontwijkingsmechanisme was ongekend bij dit virus en heeft belangrijke gevolgen voor de ontwikkeling van vaccins voor dit en andere virussen.

Dataminingtechnieken

De studie maakt deel uit van een grootschalig project waarin immunologen en computerwetenschappers samenwerken om - aan de hand van nieuwe methoden uit de informatica - de interacties tussen ziektes en het menselijk immuunsysteem te doorgronden. Experimenteel is het erg moeilijk dergelijke interacties te bestuderen. In dit project maken onderzoekers echter gebruik van ‘machine learning’ technieken, die toelaten om computers zelf te laten leren van grootschalige data.

'Gelijkaardige technieken worden gebruikt door grote bedrijven als Google en Facebook om bijvoorbeeld inzichten te halen uit sociale netwerken”, stelt prof. dr. Kris Laukens. “Dit onderzoek toont aan hoe moderne dataminingtechnieken uit grootschalige moleculaire gegevens fundamenteel nieuwe biomedische inzichten kunnen opleveren.'

Het onderzoek verschijnt deze week in het vakblad Immunogenetics.